CTAB法,即CTAB-酚-氯仿法,是一种常用的DNA提取方法,适用于细菌、真菌等多种微生物的DNA提取。以下是CTAB法提取细菌DNA的详细步骤:
1. 样品准备
- 取适量的细菌样品,可以是纯培养物或临床样本。
- 将样品加入适量的无菌生理盐水中,轻轻振荡混匀。
- 8000g离心5分钟,弃去上清液,保留沉淀。
2. 细胞裂解
- 向沉淀中加入等体积的CTAB裂解缓冲液(含有CTAB、NaCl、Tris-HCl、EDTA等成分)。
- 65℃水浴30分钟,使细胞壁和细胞膜破裂,DNA释放到溶液中。
3. 去除蛋白质
- 加入等体积的酚-氯仿-异戊醇混合液(25:24:1),充分混匀。
- 12,000g离心10分钟,分离出含DNA的上层水相。
4. 纯化DNA
- 向上层水相中加入等体积的冰乙醇,混匀后放置-20℃冰箱中至少30分钟。
- 12,000g离心10分钟,弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀。
- 12,000g离心5分钟,弃去上清液,干燥DNA沉淀。
5. 溶解DNA
- 向DNA沉淀中加入适量的无菌去离子水,溶解DNA。
6. DNA定量
- 使用分光光度计测定DNA溶液的OD260/280值,计算DNA浓度。
7. DNA储存
- 将DNA溶液转移至无菌离心管中,加入适量的RNA酶抑制剂,储存于-20℃或-80℃冰箱中。
CTAB法提取真菌DNA的原理
CTAB法提取真菌DNA的原理主要基于以下几个步骤:
1. CTAB结合DNA
- CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,能够与DNA分子结合,形成稳定的复合物。
2. 细胞裂解
- CTAB裂解缓冲液中的NaCl和Tris-HCl能够破坏细胞膜和细胞壁,使细胞内容物释放出来。
3. 去除蛋白质
- 酚-氯仿-异戊醇混合液能够破坏蛋白质的疏水相互作用,使蛋白质沉淀,从而去除蛋白质。
4. DNA纯化
- DNA与CTAB形成的复合物在乙醇中沉淀,而蛋白质和其他杂质则留在上清液中。
5. DNA溶解
- 通过加入去离子水,可以使DNA从CTAB复合物中解离出来,形成可溶解的DNA溶液。
CTAB法提取真菌DNA具有操作简便、效率高、DNA纯度好等优点,是实验室中常用的DNA提取方法之一。